https://download.owncloud.org/download/repositories/stable/owncloud/
добавить ключ
wget -nv https://download.owncloud.org/download/repositories/stable/Ubuntu_16.04/Release.key -O Release.key
apt-key add - < Release.key

добавить репозитарий
sh -c "echo 'deb http://download.owncloud.org/download/repositories/stable/Ubuntu_16.04/ /' >> /etc/apt/sources.list.d/owncloud.list"
apt-get update
установить
apt-get install owncloud
при обновлении выполнить
sudo -u www-data php occ upgrade
sudo -u www-data php /var/www/owncloud/occ maintenance:mode --off